Lediga jobb som Bioinformatiker i Lund

Gör skillnad. Varje dag.

Verksamhetsområde klinisk genetik, patologi och molekylär diagnostik har drygt 400 medarbetare fördelade på fyra orter i Skåne och består av sektionerna Klinisk genetik, Klinisk patologi och Molekylär diagnostik. Sektionen för molekylär diagnostik bildades 2021 och vi är idag över 110 medarbetare. Vi arbetar för att stärka och utveckla verksamheten inom det snabbt expanderande fältet molekylär diagnostik och precisionsmedicin. Vårt uppdrag är att bedriva högspecialiserad och modern laboratoriediagnostik inom olika metodområden utifrån sjukvårdens växande behov. Vi bedriver vårt arbete i nära samarbete med övriga laboratoriemedicinska specialiteter inom Region Skåne och sjukhusförvaltningarna samt i nära samverkan med Lunds universitet och inom ramen för nationella initiativ såsom Genomic Medicine Sweden.

Inom sektion Molekylär diagnostik utförs laboratorieanalyser inom allt från klassisk cytogenetik, massiv parallell sekvensering (MPS/NGS) och riktade dPCR-/PCR-/FISH-baserade genetiska analyser. Arbetet är främst inriktat på rutindiagnostik, men är parallellt mycket utvecklingsintensiv där nya analyser och metoder löpande implementeras i klinisk rutin. Under år 2025 utfördes mer än 38 000 kliniska analyser inom sektionen, inklusive drygt 13 000 NGS-analyser med inriktning mot cancer, ärftliga frågeställningar och infektionssjukdomar. Vid sektionens NGS-facilitet, centrum för molekylär diagnostik (CMD), arbetar cirka 37 medarbetare med expertis inom NGS och bioinformatik.

Bioinformatik- och mjukvaruteamet består av tolv personer med olika specialistkompetenser. Teamet sköter tillsammans utveckling och drift av allt från bioinformatiska pipelines och infrastruktur till IT-system, labbintegration/-automation och mjukvaror för tolkning av analysresultat. Arbetet sker i Linux-baserade miljöer, på bland annat ett dedikerat kluster med 1272 CPU-cores för high performance computation som specialbyggts för verksamheten. NGS-data genereras på CMD i en av Sveriges större maskinparker för short-read-sekvensering, med bland annat två Illumina NovaSeq 6000, en NovaSeq X Plus. För long-read finns en PacBio Revio och Oxford Nanopore.

Vi söker nu en driven och lösningsorienterad medarbetare till vårt bioinformatikteam.

ARBETSUPPGIFTER
Dina huvudsakliga arbetsuppgifter är att:

• arbeta med utveckling av nya bioinformatiska flöden inom bland annat helgenom- och transkriptomanalys på allt från virus till människor
• ansvara för drift och kontinuerliga förbättringar av etablerade bioinformatiska flöden
• arbeta med utveckling, drift och förbättring av mjukvaror för visualisering och utvärdering av bioinformatiska resultat
• stödja genetiker/molekylärbiologer kring tolkning av genetisk data eller i tekniska frågor rörande sekvensering eller bioinformatik
• arbeta i nationella spjutspetssamarbeten inom genomik och bioinformatik.

Vårt arbete ligger alltid i framkant och därmed sker i princip all utveckling av nya analyser på plats, från grunden. Nya analyser sätts upp löpande och som bioinformatiker deltar du i allt från planering, vidare till implementering och validering och slutligen underhåll av robusta pipelines. Inom gruppen och i nationella nätverk finns en mångfald av kompetens inom bioinformatik, programmering och systemadministration. Vi delar mycket av vårt arbete offentligt via github (https://github.com/SMD-Bioinformatics-Lund/) och vi använder oss i högsta möjliga grad av mjukvaror med öppen källkod.

KVALIFIKATIONER
Vi välkomnar dig med kandidat- eller magisterexamen inom adekvat ämnesområde, med bioinformatik och genomik som bas, alternativt minst fyra års relevant arbetserfarenhet inom bioinformatik från näringsliv, sjukvård eller akademi. Du har goda kunskaper i svenska och/eller engelska i såväl tal som skrift.

För rollen krävs även att du har erfarenhet av:
- arbete med sekvenseringsdata (DNA- och/eller RNA-baserat)
- arbete i versionshanteringssystemet git
- arbete i en terminalbaserad Linux-miljö
- minst ett skriptspråk, exempelvis Python, Perl eller R.

Utöver detta är det meriterande om du har doktorsutbildning inom bioinformatik, genomik eller motsvarande. Det är även meriterande med erfarenhet av följande:

- arbete med containers (exempelvis Apptainer och Docker) och workflow managers (exempelvis Nextflow och nfcore, eller Snakemake)
- arbete i en verksamhet med dokumenteringskrav, såsom från ett ackrediterat laboratorium
- arbete i gemensam kodbas
- databaser (MongoDB eller )
- python flask eller liknande
- javascript framework av något slag.

För att lyckas i rollen behöver du ha god samarbets- och kommunikationsförmåga samt kunna prioritera ditt arbete. Därtill har du god problemlösningsförmåga, är noggrann och har förmåga att arbeta självständigt även då befintliga rutiner saknas. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Vi tillämpar löpande urval i denna rekrytering, varmt välkommen med din ansökan redan idag!

ÖVRIGT
Region Skåne finns till för att alla som bor i Skåne ska må bra och känna framtidstro. Genom gränslösa samarbeten och omtanke skapas de bästa förutsättningar för ett hälsosamt liv inom näringsliv, kollektivtrafik, kultur och hälso- och sjukvård i Skåne. Tillsammans gör vi livet mera möjligt.

Medicinsk service är en av Region Skånes tolv hälso- och sjukvårdsförvaltningar, med cirka 2 000 medarbetare. Vi möter vårdens behov av ambulanssjukvård, bild- och laboratorieteknik, klinisk träning och laboratoriemedicin. Den laboratoriemedicinska verksamheten omfattar områdena arbets- och miljömedicin, biobank, genetik, immunologi och transfusionsmedicin, kemi, farmakologi, mikrobiologi samt patologi. Även smittskydd och vårdhygien tillhör förvaltningen. Inom förvaltningen bedriver vi även forskning.

På https://www.skane.se/ledigajobb kan du se i vilket skede Region Skånes rekryteringar befinner sig och hur många som har sökt tjänsterna.

Om du har skyddade personuppgifter ska du kontakta den kontaktperson som finns angiven i annonsen så att din ansökan blir hanterad enligt särskilda rutiner.
När du söker ett jobb hos Region Skåne blir din ansökan en allmän handling enligt offentlighetsprincipen. Uppgifterna behandlas och sparas enligt dataskyddsförordningen (GDPR).

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser. Visa mindre

Gör skillnad. Varje dag.

Verksamhetsområde klinisk genetik, patologi och molekylär diagnostik har drygt 400 medarbetare fördelade på fyra orter i Skåne och består av sektionerna Klinisk genetik, Klinisk patologi och Molekylär diagnostik. Sektionen för molekylär diagnostik bildades 2021 och vi är idag över 110 medarbetare. Vi arbetar för att stärka och utveckla verksamheten inom det snabbt expanderande fältet molekylär diagnostik och precisionsmedicin. Vårt uppdrag är att bedriva högspecialiserad och modern laboratoriediagnostik inom olika metodområden utifrån sjukvårdens växande behov. Vi bedriver vårt arbete i nära samarbete med övriga laboratoriemedicinska specialiteter inom Region Skåne och sjukhusförvaltningarna samt i nära samverkan med Lunds universitet och inom ramen för nationella initiativ såsom Genomic Medicine Sweden.

Inom sektion Molekylär diagnostik utförs laboratorieanalyser inom allt från klassisk cytogenetik till massiv parallell sekvensering (MPS/NGS) via riktade dPCR-/PCR-/FISH-baserade genetiska analyser. Arbetet är främst inriktat på rutindiagnostik, men är parallellt mycket utvecklingsintensiv där nya analyser och metoder löpande implementeras i klinisk rutin. Under år 2023 utfördes mer än 38 000 kliniska analyser inom sektionen, inklusive drygt 13 000 NGS-analyser med inriktning på cancer, ärftliga frågeställningar och infektionssjukdomar. Vid sektionens NGS-facilitet, CMD (centrum för molekylär diagnostik), arbetar cirka 37 medarbetare med expertis inom NGS och bioinformatik.

Bioinformatik- och mjukvaruteamet består av tolv personer med olika specialistkompetenser. Teamet sköter tillsammans utveckling och drift av allt från bioinformatiska pipelines och infrastruktur till IT-system, labbintegration/-automation och mjukvaror för tolkning av analysresultat. NGS-data genereras på CMD i en av Sveriges större maskinparker för short-read-sekvensering, med bland annat två Illumina NovaSeq 6000. Laboratory Information Management Systems (LIMS), används för att dokumentera provflödet från att ett prov anländer till sektionen till ett analysresultat svaras ut. Clarity LIMS, som har använts vid CMD sedan 2016, håller på att etableras inom hela sektionen för molekylär diagnostik och kopplas samman med laboratoriemedicins andra gemensamma IT-system (bland annat LabVantage).

Vi söker nu en ny medarbetare som vill vara med i vårt arbete att vidareutveckla och expandera Clarity LIMS till hela Sektion molekylär diagnostik.


ARBETSUPPGIFTER
Tjänsten vi erbjuder är ett vikariat på tolv månader med möjlighet till förlängning och passar dig som är driven och lösningsorienterad.

Dina huvudsakliga arbetsuppgifter är bland annat att bygga nya arbetsflöden i Clarity LIMS, ansvara för drift och kontinuerliga förbättringar av etablerade arbetsflöden, och hålla utbildning för nya medarbetare. Du kommer även att vara med och införa Clarity LIMS på delar inom vår sektion som inte jobbar i systemet idag.

Vårt arbete ligger alltid i framkant och därmed sker i princip all utveckling av nya analyser på plats, från grunden. Nya analyser sätts upp löpande. Du kommer då att ansvara för att bygga provflöden i Clarity LIMS som ska dokumentera det laborativa arbetets gång, skapa integration med instrument, ge hjälp med olika uträkningar i labbet och sammanställa information till slutanalysen vilket antingen kan vara en bioinformatisk pipeline eller en rapport. Du kommer att delta i allt från planering, implementering och validering och slutligen underhåll av robusta arbetsflöden i Clarity LIMS. Programmeringen sker huvudsakligen i Python och systemspecifikt i Clarity LIMS. Inom arbetsgruppen och i nationella nätverk finns en mångfald av kompetens inom bioinformatik, programmering och systemadministration. Vi delar mycket av vårt arbete via github https://github.com/Clinical-Genomics-Lund och vi använder oss i högsta möjliga grad av mjukvaror med öppen källkod.


KVALIFIKATIONER
Vi välkomnar dig med kandidat- eller magisterexamen inom teknisk eller naturvetenskaplig inriktning såsom ingenjörsutbildning eller inom bioinformatik. Alternativt erfarenhet inom annat relevant område. Du har goda kunskaper i svenska och engelska i såväl tal som skrift. För rollen krävs även att du har erfarenhet av arbete i en terminalbaserad Linux-miljö och i skriptspråket Python.

Det är starkt meriterande med erfarenhet av arbete i versionshanteringssystemet Git samt arbete i en verksamhet med dokumenteringskrav, såsom från ett ackrediterat laboratorium samt med laborativt arbete. Skicka gärna med exempel på kod du själv har skrivit. Har du erfarenhet av LIMS, framför allt Clarity LIMS och LabVantage LIMS ses det också som meriterande. Likaså erfarenhet av IT-infrastruktur, kravhantering samt av undervisning eller handledning.

För att lyckas i rollen behöver du ha god samarbets- och kommunikationsförmåga samt kunna prioritera ditt arbete. Rollen kräver goda programmeringskunskaper där vi lägger stor vikt vid reproducerbarhet och noggrannhet. Du har god problemlösningsförmåga, och kan arbeta självständigt även då befintliga rutiner saknas. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Vi tillämpar löpande urval i denna rekrytering, varmt välkommen med din ansökan redan idag!


ÖVRIGT
Region Skåne finns till för att alla som bor i Skåne ska må bra och känna framtidstro. Genom gränslösa samarbeten och omtanke skapas de bästa förutsättningar för ett hälsosamt liv inom näringsliv, kollektivtrafik, kultur och hälso- och sjukvård i Skåne. Tillsammans gör vi livet mera möjligt.

Medicinsk service är en av Region Skånes elva hälso- och sjukvårdsförvaltningar, med cirka 2 000 medarbetare. Vi möter vårdens behov av ambulanssjukvård, bild- och laboratorieteknik, klinisk träning, laboratoriemedicin och sjukvårdsrådgivning. Den laboratoriemedicinska verksamheten omfattar områdena arbets- och miljömedicin, biobank, genetik, immunologi och transfusionsmedicin, kemi, farmakologi, mikrobiologi samt patologi. Även smittskydd och vårdhygien tillhör förvaltningen. Inom förvaltningen bedriver vi även forskning.

På https://www.skane.se/ledigajobb kan du se i vilket skede Region Skånes rekryteringar befinner sig och hur många som har sökt tjänsterna.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser. Visa mindre

Gör skillnad. Varje dag.

Verksamhetsområde klinisk genetik, patologi och molekylär diagnostik har drygt 400 medarbetare fördelade på fyra orter i Skåne och består av sektionerna Klinisk genetik, Klinisk patologi och Molekylär diagnostik. Sektionen för molekylär diagnostik bildades 2021 och vi är idag över 110 medarbetare. Vi arbetar för att stärka och utveckla verksamheten inom det snabbt expanderande fältet molekylär diagnostik och precisionsmedicin. Vårt uppdrag är att bedriva högspecialiserad och modern laboratoriediagnostik inom olika metodområden utifrån sjukvårdens växande behov. Vi bedriver vårt arbete i nära samarbete med övriga laboratoriemedicinska specialiteter inom Region Skåne och sjukhusförvaltningarna samt i nära samverkan med Lunds universitet och inom ramen för nationella initiativ såsom Genomic Medicine Sweden.

Inom sektion Molekylär diagnostik utförs laboratorieanalyser inom allt från klassisk cytogenetik till massiv parallell sekvensering (MPS/NGS) via riktade dPCR-/PCR-/FISH-baserade genetiska analyser. Arbetet är främst inriktat på rutindiagnostik, men är parallellt mycket utvecklingsintensiv där nya analyser och metoder löpande implementeras i klinisk rutin. Under år 2024 utfördes mer än 41 000 kliniska analyser inom sektionen, inklusive drygt 12 000 NGS-analyser med inriktning på cancer, ärftliga frågeställningar och infektionssjukdomar. Vid sektionens NGS-facilitet, Centrum för molekylär diagnostik (CMD), arbetar cirka 37 medarbetare med expertis inom NGS och bioinformatik.

Bioinformatik- och mjukvaruteamet består av tolv personer med olika specialistkompetenser. Teamet sköter tillsammans utveckling och drift av allt från bioinformatiska pipelines och infrastruktur till IT-system, labbintegration/-automation och mjukvaror för tolkning av analysresultat. NGS-data genereras på CMD i en av Sveriges större maskinparker för short- och long-read-sekvensering, med bland annat två Illumina NovaSeq 6000 och en PacBio Revio. Laboratory Information Management Systems (LIMS), används för att dokumentera provflödet från att ett prov anländer till sektionen till ett analysresultat svaras ut. Clarity LIMS, som har använts vid CMD sedan 2016, håller på att etableras inom hela sektionen för molekylär diagnostik och kopplas samman med laboratoriemedicins andra gemensamma IT-system.

Vi söker nu en ny medarbetare som vill vara med i vårt arbete att vidareutveckla och expandera Clarity LIMS till hela Sektion molekylär diagnostik.

ARBETSUPPGIFTER
Tjänsten vi erbjuder passar dig som är driven och lösningsorienterad.

Dina huvudsakliga arbetsuppgifter är bland annat att bygga nya arbetsflöden i Clarity LIMS, ansvara för drift och kontinuerliga förbättringar av etablerade arbetsflöden, och hålla utbildning för nya medarbetare. Du kommer även att vara med och införa Clarity LIMS på delar inom vår sektion som inte jobbar i systemet idag.

Vårt arbete ligger alltid i framkant och därmed sker i princip all utveckling av nya analyser på plats, från grunden. Nya analyser sätts upp löpande. Du kommer då att ansvara för att bygga provflöden i Clarity LIMS som ska dokumentera det laborativa arbetets gång, skapa integration med instrument, ge hjälp med olika uträkningar i labbet och sammanställa information till slutanalysen vilket antingen kan vara en bioinformatisk pipeline eller en rapport. Du kommer att delta i allt från planering, implementering till validering och slutligen underhåll av robusta arbetsflöden i Clarity LIMS. Programmeringen sker huvudsakligen i Python och systemspecifikt i Clarity LIMS. Inom arbetsgruppen och i nationella nätverk finns en mångfald av kompetens inom bioinformatik, programmering och systemadministration. Vi delar mycket av vårt arbete via github och vi använder oss i högsta möjliga grad av mjukvaror med öppen källkod.

KVALIFIKATIONER
Vi välkomnar dig med kandidat- eller magisterexamen inom teknisk eller naturvetenskaplig inriktning såsom ingenjörsutbildning eller inom bioinformatik. Alternativt erfarenhet inom annat relevant område. Du har goda kunskaper i svenska och engelska i såväl tal som skrift. För rollen krävs även att du har erfarenhet av arbete i en terminalbaserad Linux-miljö och i skriptspråket Python.

Det är starkt meriterande med erfarenhet av arbete i versionshanteringssystemet Git samt arbete i en verksamhet med dokumenteringskrav, såsom från ett ackrediterat laboratorium samt med laborativt arbete. Skicka gärna med exempel på kod du själv har skrivit. Har du erfarenhet av LIMS, framför allt Clarity LIMS och LabVantage LIMS ses det också som meriterande. Likaså erfarenhet av IT-infrastruktur, kravhantering samt av undervisning eller handledning.

För att lyckas i rollen behöver du ha god samarbets- och kommunikationsförmåga samt kunna prioritera ditt arbete. Rollen kräver goda programmeringskunskaper där vi lägger stor vikt vid reproducerbarhet och noggrannhet. Du har god problemlösningsförmåga, och kan arbeta självständigt även då befintliga rutiner saknas. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Vi tillämpar löpande urval i denna rekrytering, varmt välkommen med din ansökan redan idag!

ÖVRIGT
Region Skåne finns till för att alla som bor i Skåne ska må bra och känna framtidstro. Genom gränslösa samarbeten och omtanke skapas de bästa förutsättningar för ett hälsosamt liv inom näringsliv, kollektivtrafik, kultur och hälso- och sjukvård i Skåne. Tillsammans gör vi livet mera möjligt.

Medicinsk service är en av Region Skånes tolv hälso- och sjukvårdsförvaltningar, med cirka 2 000 medarbetare. Vi möter vårdens behov av ambulanssjukvård, bild- och laboratorieteknik, klinisk träning och laboratoriemedicin. Den laboratoriemedicinska verksamheten omfattar områdena arbets- och miljömedicin, biobank, genetik, immunologi och transfusionsmedicin, kemi, farmakologi, mikrobiologi samt patologi. Även smittskydd och vårdhygien tillhör förvaltningen. Inom förvaltningen bedriver vi även forskning.

På https://www.skane.se/ledigajobb kan du se i vilket skede Region Skånes rekryteringar befinner sig och hur många som har sökt tjänsterna.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser. Visa mindre

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 47 000 studenter och mer än 8 800 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.


Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.




Beskrivning av arbetsplatsen
Institutionen för Immunteknologi bedriver forskning inom livsvetenskaperna såsom immunologi, onkologi, och hyperkänslighet/allergi.

De moderna lokalerna är belägna på Medicon Village där akademisk forskning bedrivs sida vid sida med privata företag och aktörer från sjukvårdssektorn. En rad viktiga infrastrukturer finns tillgängliga här, bland annat speciallaboratorier för spatial omik, masspektrometri, flödescytometri och antikroppsframställning, samt NBIS (National Bioinformatics Infrastructure Sweden). Tillämpningen av avancerade tekniker för att lösa komplexa biomedicinska utmaningar har bidragit till att institutionen ligger i framkant i flera forskningsområden och ett flertal spin-off bolag är också verksamma på Medicon Village. Du kommer vara del av en forskningsgrupp som är dedikerad till utveckling av precisionsmedicin inom onkologi, vilket bygger på translationell forskning på molekylära och cellulära processer i cancer

Vi erbjuder
Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss

Arbetsuppgifter
Du kommer vara del av en forskningsgrupp som fokuserar på spatial tumörbiologi. Vi kartlägger interaktioner mellan tumör och immunceller för att förstå immunsvar i tumörer och hur immunsystemet kan stimuleras för ett bättre behandlingssvar. Vi jobbar i multidisciplinära, translationella projekt för att utveckla verktyg för precisionsmedicin. Du kommer ha särskilt ansvar för att ta fram prediktionsmodeller för äggstockscancer. Arbetet innefattar analys av vävnadsbilder från multiplex immunfluorescence, grafbaserad bildanalys och utveckling av artificiella neurala nätverk. Du kommer även att jobba med analys av spatial transkriptomikdata. Dokumentation av kod och arbetsflöden, sammanställning av data, samt kommunikation av resultat till den egna gruppen och samarbetspartners är viktiga delar i arbetet.

Kvalifikationer
Krav för anställningen är:

- Masterutbildning i bioinformatik
- Omfattande erfarenhet av bioinformatik och sammanställning av relaterad dokumentation
- Praktisk erfarenhet av djupinlärningsmetoder
- Praktisk erfarenhet av jobb i Python och Git
- Erfarenhet av bildanalys
- Mycket goda kunskaper i skriftlig och muntlig engelska
- Mycket god samarbets- och kommunikationsförmåga

Meriterande för anställningen är:

- Praktisk erfarenhet av arbete i Qupath
- Praktisk erfarenhet av storskalig protein och/eller RNA-data
- Erfarenhet av att jobba i beräkningsklustermiljö
- Erfarenhet av dataanalys av patientmaterial
- Kunskap inom tumör- och/eller immunmarkörer



Vi kommer att lägga stor vikt vid personlig lämplighet, med avseende på exempelvis god samarbetsförmåga, driv och självständighet.

Övrigt
Anställningen är en visstidsanställning under 11 månader på 100 % med startdatum den 1 september  2024 eller enligt överenskommelse.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.

LTH – Lunds Tekniska Högskola – är den tekniska fakulteten vid Lunds universitet. På LTH utbildar vi människor, bygger kunskap för framtiden och arbetar hårt för att utveckla samhället. Vi skapar utrymme för briljant forskning och inspirerar till kreativ utveckling av teknik, arkitektur och design. Här läser närmare 10 000 studenter. Varje år publicerar våra forskare – varav många verkar inom världsledande profilområden – omkring 100 avhandlingar och 2 000 vetenskapliga rön. En rad forskningsresultat och studentarbeten förädlas till innovationer. Tillsammans utforskar och skapar vi – till nytta för världen.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler. Visa mindre

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns cirka 46 000 studenter och mer än 8 000 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.


Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.




Beskrivning av arbetsplatsen
Lund University Diabetes Centre (LUDC; http://www.

ludc.med.lu.se) utlyser härmed en tjänst som bioinformatiker. LUDC är ett av världens största diabetescentrum med cirka 300 anställda (forskare och övrig personal) som arbetar för att förebygga diabetes samt förbättra diagnostik och behandling av diabetes. För att nå dessa mål arbetar vi vid centret för att kombinera expertis inom genetik, epidemiologi, bioinformatik, molekylär- och cellbiologi, fysiologi och klinisk diabetes och endokrinologi. LUDC har stora unika biobanker och databaser med helgenomsdata länkade till nationella register med data om sjukdomsuppkomst och -förlopp, samt till register med data om behandling och behandlingsrespons. Centret har egna plattformar för de flesta molekylära genetiska metoderna och metabolomik. Tack vare Omics-information kombinerat med utförliga fenotypdata kan vi använda oss av ”systems medicine” för att förstå komplexiteten av diabetes. Ett viktigt mål för LUDC är att utveckla individanpassad behandling för att förbättra hälsan och livskvaliteten för patienter med diabetes.

 

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Sökanden inbjuds att ansöka om en tillsvidareanställning på heltid (100 %) som bioinformatiker vid LUDC. Anställningen inleds med sex månaders provanställning. Preliminärt startdatum är 2023-04-01 eller enligt överenskommelse.

Den sökande som anställs (bioinformatikern) kommer att ingå i enheten för bioinformatik vid LUDC, som innefattar flera bioinformatiker, en biostatistiker, en data manager, en dataingenjör och en IT-data manager (https://www.ludc.lu.se/resources/ludc-bioinformatics-unit). Enheten tillhandahåller bioinformatik, biostatistik och computational support till alla som är anslutna till LUDC, samt tillgång till en datormiljö med hög prestanda. Supporten omfattar delaktighet i både långsiktiga forskningsprojekt och mindre omfattande projekt, samt att vara tillgänglig för konsultationer, frågor och vägledning inom ramen för olika LUDC projekt.

En komplettbeskrivning av arbetsuppgifter, kvalifikationskrav och annat relevant för anställning finner du här: https://lu.varbi.com/se/what:job/jobID:589445/type:job/where:4/apply:1

 

Så här söker du
Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska/bör även innehålla CV, publikationslista och uppgifter till 3 referenser.

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Institutionen för kliniska vetenskaper i Malmö är en av de sex institutionerna vid Lunds universitets medicinska fakultet. Vi har ett starkt fokus på klinisk och epidemiologisk forskning, och bedriver även en omfattande preklinisk laboratorieforskning.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler. Visa mindre

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns cirka 45 000 studenter och mer än 8 000 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.


Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.




Bekrivning av arbetsplatsen
Forskningsgruppen studerar genetiska förändringar i mjukdelstumörer.

Du kan läsa mer om vår forskning https://portal.research.lu.se/sv/organisations/the-genetics-of-soft-tissue-tumors
Syftet är att öka kunskapen om hur dessa tumörer uppkommer och utvecklas. Projektet har en tydlig translationell inriktning, med målen att hitta diagnostiska markörer samt biomarkörer som kan förutsäga patientens prognos eller utgöra nya behandlingsmål. Gruppen består av teknisk personal, doktorander samt bioinformatiker. Gruppen leds av professor Fredrik Mertens och verksamheten bedrivs huvudsakligen vid Biomedicinskt centrum (BMC) i Lund, där gruppen är samlokaliserad med övriga forskargrupper inom sektionen för klinisk genetik.

Vi erbjuder
Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension.
Lägg gärna in information om vad just ni kan erbjuda som ny arbetsplats ex:
”Vi har även ett flextidsavtal som skapar goda förutsättningar för balans mellan arbete och fritid.”
Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss https://www.lu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss

Arbetsuppgifter
Arbetsuppgifterna utgörs av analys av sekvensdata från mjukdelstumörer samt sammanställning av resultat i vetenskapliga artiklar.


Kvalifikationer
Tjänsten riktar sig till den som har doktorsgrad (PhD) i genetik/biologi/medicin och som har genomfört åtminstone 3 års postdoktoral träning vid utgången av ansökningsperioden

Krav för anställningen är

- God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet.
- Doktorsgrad i relevant ämne, med fokus på MPS-baserade analyser av tumörer. Doktorsgraden ska ha erhållits under perioden 2018-2021.
- Egen erfarenhet av analys av MPS-baserade data, inkluderande såväl på transkriptom- som genomnivå.
- Goda kunskaper inom analys av epigenetiska data från tumörer.
- Goda kunskaper om sarkombiologi, dokumenterad genom publikationer i internationella vetenskapliga tidskrifter.
- Mycket goda kunskaper i engelska.

Meriterande för anställning:

- Tidigare erfarenhet av att genomföra studier där olika typer av MPS-data samordnas (”multi-omics”).

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper, såsom samarbetsförmåga. Anställningen kommer att ställa stora krav på förmåga att arbeta såväl självständigt som i grupp.

Övrigt
Anställningen är en tillsvidareanställning på heltid (provanställning på 6 månder kan komma att tillämpas). Önskat startdatum är 2024-09-01 eller enligt överenskommelse.

Så här söker du
Ansökan måste innehålla ett personligt brev i vilket det framgår hur den sökande möter anställningskraven, ett CV samt intyg på genomgångna högskoleutbildningar.

 

 






 

 

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.




 

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Institutionen för laboratoriemedicin (ILM) är en av sex institutioner vid Medicinska fakulteten. Vi bedriver ledande forskning inom det laboratoriemedicinska fältet med fokus på hur sjukdomar uppkommer och hur vi kan förbättra patienters diagnostik och behandling. Några av våra starkaste områden med forskning i världsklass, handlar om cancer-, genetik- och blodforskning.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler. Visa mindre

Gör skillnad. Varje dag.

Verksamhetsområde klinisk genetik och patologi har drygt 400 medarbetare fördelade på fyra orter i Skåne och består av sektionerna klinisk genetik, klinisk patologi och molekylär diagnostik. Sektionen för molekylär diagnostik, med drygt 90 medarbetare, har som uppdrag att bedriva högspecialiserad och modern laboratoriediagnostik inom olika metodområden utifrån sjukvårdens växande behov. Vårt arbete sker i nära samverkan med Lunds universitet och inom ramen för nationella initiativ såsom Genomic Medicine Sweden.

Inom sektionen för molekylär diagnostik ingår bland annat Centrum för Molekylär Diagnostik (CMD), där arbetet främst är inriktat på massiv parallell sekvensering (MPS/NGS). CMD bedriver rutindiagnostik inom flera områden, såsom genpaneler och helgenomsekvensering, men är parallellt mycket utvecklingsintensiv. Under år 2021 utfördes mer än 14000 NGS-analyser (varav 7000 var SARS-CoV-2) vid CMD med inriktning på cancer, ärftliga frågeställningar och mikrobiologi. På CMD arbetar cirka 35 medarbetare med expertis inom NGS och bioinformatik.

Bioinformatikteamet består av 11 personer med olika specialistkompetenser, som tillsammans sköter utveckling och drift av allt från bioinformatiska pipelines och infrastruktur till IT-system, labbintegration/-automation och mjukvaror för tolkning av analysresultat. Teamet jobbar även i ett tätt samarbete med bioinformatiker inom Centrum för translationell genomik, Lunds universitet. Arbetet sker i Linux-baserade miljöer, på bland annat ett dedikerat kluster med 1272 CPU-cores för high performance computation som specialbyggts för verksamheten. Nationellt arbetas det även med att implementera en storskalig molnbaserad lösning (Nationell genomikplatform) som kommer att bli en resurs för beräkning, analys och lagring för alla regioner i landet. Data genereras på CMD i en av Sveriges större maskinparker för short-read-sekvensering, med bland annat två Illumina NovaSeq 6000.

ARBETSUPPGIFTER
Vi söker en driven och lösningsorienterad medarbetare till vårt bioinformatikteam. Tjänsterna går delvis att anpassa och utforma utifrån dina erfarenheter och kunskaper, men extra intresse finns för en person med erfarenheter utav full stack programmering.

Dina huvudsakliga arbetsuppgifter är att:
• Arbeta med utveckling av nya bioinformatiska flöden inom bland annat helgenom- och transkriptomanalys på allt från virus till människor.
• Ansvara för drift och kontinuerliga förbättringar av etablerade bioinformatiska flöden.
• Arbeta med utveckling, drift och förbättring av mjukvaror för visualisering och utvärdering av bioinformatiska resultat.
• Stödja genetiker/molekylärbiologer kring tolkning av genetisk data eller i tekniska frågor rörande sekvensering eller bioinformatik.
• Arbeta i nationella spjutspetssamarbeten inom genomik och bioinformatik.
• Sätta upp, utveckla samt förfina nya och befintliga front-end-system.

Vårt arbete ligger alltid i framkant och därmed sker i princip all utveckling av nya analyser på plats, från grunden. Nya analyser sätts upp löpande och som bioinformatiker deltar du i allt från planering, vidare till implementering och validering och slutligen underhåll av robusta pipelines. Inom gruppen och i nationella nätverk finns en mångfald av kompetens inom bioinformatik, programmering och systemadministration. Vi delar mycket av vårt arbete offentligt via github (https://github.com/Clinical-Genomics-Lund) och vi använder oss i högsta möjliga grad av mjukvaror med öppen källkod.

KVALIFIKATIONER
Vi välkomnar dig med kandidat- eller magisterexamen inom adekvat ämnesområde, med bioinformatik och genomik som bas, alternativt minst fyra års relevant arbetserfarenhet inom bioinformatik från näringsliv, sjukvård eller akademi. Du har goda kunskaper i svenska i såväl tal som skrift. Har du dessutom goda kunskaper i engelska ser vi det som en fördel.

För rollen krävs även att du har erfarenhet av:
- arbete med sekvenseringsdata (DNA- och/eller RNA-baserat)
- arbete i versionshanteringssystemet git
- arbete i en terminalbaserad Linux-miljö
- minst ett skriptspråk, exempelvis Python, Perl eller R

Utöver detta är det meriterande om du har doktorsutbildning inom bioinformatik, genomik eller motsvarande. Det är även meriterande med erfarenhet av följande:

- arbete med containers (exempelvis Singularity och Docker) och workflow managers (exempelvis Nextflow och nfcore, eller Snakemake)
- arbete i en verksamhet med dokumenteringskrav, såsom från ett ackrediterat laboratorium
- arbete i gemensam kodbas
- databaser ( eller mongodb)
- python flask eller liknande
- react eller liknande

För att lyckas i rollen behöver du ha god samarbets- och kommunikationsförmåga samt kunna prioritera ditt arbete. Därtill har du god problemlösningsförmåga, är noggrann och har förmåga att arbeta självständigt även då befintliga rutiner saknas. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Vi tillämpar löpande urval i denna rekrytering, varmt välkommen med din ansökan redan idag!

ÖVRIGT
Region Skåne finns till för att alla som bor i Skåne ska må bra och känna framtidstro. Genom gränslösa samarbeten och omtanke skapas de bästa förutsättningar för ett hälsosamt liv inom näringsliv, kollektivtrafik, kultur och hälso- och sjukvård i Skåne. Tillsammans gör vi livet mera möjligt.

Medicinsk service är en av Region Skånes sex hälso- och sjukvårdsförvaltningar, med cirka 2 000 medarbetare. Vi möter vårdens behov av ambulanssjukvård, bild- och laboratorieteknik, klinisk träning, laboratoriemedicin och sjukvårdsrådgivning. Den laboratoriemedicinska verksamheten omfattar områdena arbets- och miljömedicin, biobank, genetik, immunologi och transfusionsmedicin, kemi, farmakologi, mikrobiologi samt patologi. Förvaltningen bedriver även forskning och utveckling inom sina områden.

På http://www.skane.se/rekryteringsstatus kan du se i vilket skede Region Skånes rekryteringar befinner sig och hur många som har sökt tjänsterna.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser. Visa mindre

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns cirka 46 000 studenter och mer än 8 000 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.


Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.




Beskrivning av arbetsplatsen
Centrum för Translationell Genomik (CTG) är en prioriterad forskningsinfrastruktur vid Medicinska fakulteteten, Lunds universitet, som ingår i Clinical Genomics-plattformen inom SciLifeLab, Sveriges nationella forskningsinfrastruktur inom molekylära livsvetenskaper.

Clinical Genomics-plattformen syftar bl.a. till att erbjuda translationella och kliniska forskare tillgång till de senaste analysmetoderna inom genomik och singelcell-sekvensering, samt till att snabbt omsätta nya forskningsfynd till klinisk nytta i samarbete med hälso- och sjukvården.

Vi söker nu en driven och lösningsorienterad bioinformatiker i genomik, med särskilt fokus på singelcell-sekvensering och spatiala sekvenseringsanalyser. Som arbetsplats värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra.

Vi erbjuder
Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Vi har även ett flextidsavtal som skapar goda förutsättningar för balans mellan arbete och fritid.

Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd vid Lunds universitet, https://www.lu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss

Arbetsuppgifter och ansvarsområden
De huvudsakliga arbetsuppgifterna i tjänsten är dataanalys, dataleverans och intern projekthantering av sekvenseringsprojekt, i första hand baserade på Illumina- och Oxford Nanopore Technology-plattformarna. Såväl laborativt som bioinformatiskt är ansvarsområdena idag uppdelade inom genomik, transkriptomik, singelcell- och spatiala analyser. Fokus i den aktuella tjänsten ligger på singelcell-sekvensering (t.ex. 10X Genomics-baserat), men beroende på erfarenhet kan ansvarsområdena i den nya tjänsten delvis anpassas i dialog med ansvariga för enheten.

Mer specifikt kommer dina arbetsuppgifter att innefatta:

- Driftsansvar för befintliga bioinformatiska rutiner och flöden för data från de senaste sekvenseringsteknikerna, med särskilt fokus på singelcell-sekvensering (t.ex. mRNA, CITE-seq, ATAC-seq, multiomics).
- Utveckling av nya, och vidare optimering av befintliga bioinformatiska, flöden och analysmetoder, framför allt inom singelcell-sekvensering (genomiska applikationer) och spatiala analysmetoder (t.ex. 10X Genomics Visium).
- Bistå med bioinformatisk expertis i utvecklingsprojekt inom singelcell-sekvensering mellan CTG och lokala och nationella samarbetspartners.
- Möjlighet att delta i nationella spjutspetssamarbeten inom genomik och bioinformatik, t.ex. via SciLifeLab och det svenska nationella sekvenserings-inititivet Genomic Medicine Sweden.

Kvalifikationer
För anställningen krävs:

- Adekvat grundutbildning från universitet (d.v.s. med bioinformatik, genomik eller motsvarande som inriktning)
- erfarenhet av arbete med storskaliga sekvenseringsdata (DNA- och/eller RNA-baserat)
- erfarenhet av att arbeta i terminalbaserad Linux-miljö och i minst ett script-språk (t.ex. Python, Perl eller R)
- utmärkt förmåga till muntlig och skriftlig kommunikation på engelska

Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet. Arbetsuppgifterna kräver att du har en utmärkt förmåga till samarbete och kommunikation, en utmärkt förmåga att strukturera och prioritera i arbetet samt utmärkt förmåga att arbeta självständigt och utveckla arbetssätt, även där befintliga rutiner saknas.

Meriterande för anställningen är:

- doktorsutbildning inom adekvat forskningsområde (d.v.s. bioinformatik, genomik eller motsvarande)
- erfarenhet av arbete med genomik- och/eller transkriptomikdata
- erfarenhet av arbete med singelcell-sekvensering och/eller spatiala analyser.
- erfarenhet av arbete med bioinformatiska s.k. ”workflow managers” (t.ex. Nextflow eller Snakemake)
- erfarenhet av arbete med s.k. ”containers” (t.ex. Singularity eller Docker)
- erfarenhet av arbete med ”high-performance computing” (HPC)-kluster
- erfarenhet av arbete med, eller själv ha utvecklat, projekthanteringssystem och/eller databaser

Övrigt
Anställningen är en tillsvidareanställning på heltid med tillsättning snarast. Provanställning kan komma att bli aktuell.  

Så här söker du Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller kvalifikationskraven samt varför du är intresserad av anställningen. Ansökan ska även innehålla CV, inklusive publikationslista, en generell beskrivning av tidigare forskningsarbete, kopia av doktorsexamen samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av examensbevis, betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.)

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Institutionen för laboratoriemedicin (ILM) är en av sex institutioner vid Medicinska fakulteten. Vi bedriver ledande forskning inom det laboratoriemedicinska fältet med fokus på hur sjukdomar uppkommer och hur vi kan förbättra patienters diagnostik och behandling. Några av våra starkaste områden med forskning i världsklass, handlar om cancer-, genetik- och blodforskning.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler. Visa mindre

Gör skillnad. Varje dag.

Verksamhetsområde klinisk genetik, patologi och molekylär diagnostik har drygt 400 medarbetare och innehåller de medicinska specialiteterna Klinisk genetik och Klinisk patologi samt Sektion molekylär diagnostik. Sektionen för molekylär diagnostik, med drygt 80 medarbetare, bildades för drygt ett år sedan för att samla kompetens, resurser och teknik inom det snabbt expanderande fältet molekylär diagnostik och precisionsmedicin och har som uppdrag att bedriva högspecialiserad och modern laboratoriediagnostik inom olika metodområden utifrån sjukvårdens växande behov. Vårt arbete bedrivs i nära samarbete med övriga laboratoriemedicinska specialiteter inom Region Skåne och sjukhusförvaltningarna samt i nära samverkan med Lunds universitet och inom ramen för nationella initiativ såsom Genomic Medicine Sweden.

Inom sektionen för molekylär diagnostik utförs laboratorieanalyser inom allt från klassisk cytogenetik till massiv parallell sekvensering (MPS/NGS) via riktade dPCR-/PCR-/FISH-baserade genetiska analyser. Inom sektionen ingår bland annat Centrum för Molekylär Diagnostik (CMD), där arbetet främst är inriktat på rutindiagnostik inom MPS/NGS, såsom genpaneler och helgenomsekvensering, men är parallellt mycket utvecklingsintensiv. Under år 2021 utfördes mer än 14000 NGS-analyser (varav 7000 var SARS-CoV-2) med inriktning på cancer, ärftliga frågeställningar och mikrobiologi. På CMD arbetar cirka 25 medarbetare med expertis inom NGS och bioinformatik.

Bioinformatikteamet består av åtta personer med olika specialistkompetenser, som tillsammans sköter utveckling och drift av allt från bioinformatiska pipelines och infrastruktur till IT-system, labbintegration/-automation och mjukvaror för tolkning av analysresultat. NGS-data genereras på CMD i en av Sveriges större maskinparker för short-read-sekvensering, med bland annat två Illumina NovaSeq 6000. Laboratory Information Management Systems (LIMS), används för att dokumentera provernas resa från att de anländer till sektionen till ett analysresultat svaras ut. Vid sektionen för molekylär diagnostik pågår ett förändringsarbete där äldre LIMS-system ska fasas ut. Clarity LIMS, som har använts vid CMD sedan 2016, ska etableras inom hela sektionen för molekylär diagnostik och kopplas samman med laboratoriemedicins gemensamma nya RS LIMS (ett LabVantage LIMS).

Vi söker nu en ny medarbetare som vill vara med i vårt arbete att vidareutveckla och expandera Clarity LIMS till hela Sektion molekylär diagnostik.

ARBETSUPPGIFTER
Tjänsten vi erbjuder är ett vikariat på tolv månader med möjlighet till förlängning och passar dig som är driven och lösningsorienterad.

Dina huvudsakliga arbetsuppgifter är bland annat att bygga nya arbetsflöden i Clarity LIMS (elektronisk labbok), ansvara för drift och kontinuerliga förbättringar av etablerade arbetsflöden i LIMS och hålla utbildning för nya medarbetare i LIMS. Du kommer även att vara med och införa LIMS på verksamheter inom sektionen som inte jobbar i systemet idag.

Vårt arbete ligger alltid i framkant och därmed sker i princip all utveckling av nya analyser på plats, från grunden. Nya analyser sätts upp löpande. Du kommer då att ansvara för att bygga flöden i LIMS som ska dokumentera det laborativa arbetets gång, skapa integration med instrument, ge hjälp med olika uträkningar i labbet och sammanställa information till slutanalysen vilket antingen kan vara en bioinformatisk pipeline eller en rapport. Du kommer att delta i allt från planering, implementering och validering och slutligen underhåll av robusta arbetsflöden i LIMS. Inom gruppen och i nationella nätverk finns en mångfald av kompetens inom bioinformatik, programmering och systemadministration. Vi delar mycket av vårt arbete offentligt via github https://github.com/Clinical-Genomics-Lund och vi använder oss i högsta möjliga grad av mjukvaror med öppen källkod.

KVALIFIKATIONER
Vi välkomnar dig med kandidat- eller magisterexamen med naturvetenskaplig eller teknisk inriktning såsom ingenjörsutbildning eller inom bioinformatik alternativt utbildning inom område som arbetsgivare bedömer relevant. Du har goda kunskaper i svenska och engelska i såväl tal som skrift. För rollen krävs även att du har erfarenhet av arbete i en terminalbaserad Linux-miljö och i skriptspråket Python.

Det är meriterande med erfarenhet av arbete i versionshanteringssystemet git, i en verksamhet med dokumenteringskrav, såsom från ett ackrediterat laboratorium samt med laborativt arbete. Har du erfarenhet av LIMS, framför allt Clarity LIMS och LabVantage LIMS ses det också som meriterande. Likaså erfarenhet av IT-infrastruktur samt av undervisning eller handledning.

För att lyckas i rollen behöver du ha god samarbets- och kommunikationsförmåga samt kunna prioritera ditt arbete. Du har god problemlösningsförmåga, är noggrann och har förmåga att arbeta självständigt även då befintliga rutiner saknas. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Vi tillämpar löpande urval i denna rekrytering, varmt välkommen med din ansökan redan idag!

ÖVRIGT
Region Skåne finns till för att alla som bor i Skåne ska må bra och känna framtidstro. Genom gränslösa samarbeten och omtanke skapas de bästa förutsättningar för ett hälsosamt liv inom näringsliv, kollektivtrafik, kultur och hälso- och sjukvård i Skåne. Tillsammans gör vi livet mera möjligt.

Medicinsk service är en av Region Skånes sex hälso- och sjukvårdsförvaltningar, med cirka 2 000 medarbetare. Vi möter vårdens behov av ambulanssjukvård, bild- och laboratorieteknik, klinisk träning, laboratoriemedicin och sjukvårdsrådgivning. Den laboratoriemedicinska verksamheten omfattar områdena arbets- och miljömedicin, biobank, genetik, immunologi och transfusionsmedicin, kemi, farmakologi, mikrobiologi samt patologi. Förvaltningen bedriver även forskning och utveckling inom sina områden.

På http://www.skane.se/rekryteringsstatus kan du se i vilket skede Region Skånes rekryteringar befinner sig och hur många som har sökt tjänsterna.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser. Visa mindre

Make a difference. Every day.

The medical unit of clinical genetics and pathology has over 400 employees in four locations in Skåne and consists of the Sections for Clinical Genetics, Clinical Pathology, and Molecular Diagnostics. The Section for Molecular Diagnostics has just over 80 employees, and our mission is to conduct highly specialized and modern laboratory diagnostics in many different method areas and to introduce new methods and analyses to meet the growing needs of healthcare. Our work takes place in close collaboration with Lund University and within the framework of national initiatives such as Genomic Medicine Sweden.

The Section for Molecular Diagnostics includes the Center for Molecular Diagnostics (CMD), where the work is primarily focused on massive parallel sequencing (MPS/NGS). CMD conducts routine diagnostics in several areas, such as gene panels, and whole genome sequencing, but is at the same time very development-intensive. In 2021, more than 14000 NGS analyses (of which 7000 were SARS-CoV-2) were performed at CMD, focusing on cancer, hereditary diseases, and microbiology. At CMD, about 25 employees work with expertise in NGS, bioinformatics, and various disease areas.

The bioinformatics team comprises 8 people with different specialist competencies, who together handle the development and operation of everything from bioinformatics pipelines and infrastructure to IT systems, lab integration / automation and software for interpreting analysis results. The team also works in close collaboration with bioinformatics within the Center for Translational Genomics at Lund University. The work takes place in Linux-based environments, including a dedicated cluster with 1272 CPU cores for high performance computing specifically built for the organization. Nationally, work is underway to implement a large-scale cloud-based solution ("National Genomics Platform") which will be a resource for calculation, analysis, and storage for all regions in the country. Data is generated at CMD in one of Sweden's larger machine parks for short-read sequencing, which includes an Illumina NovaSeq 6000.

ARBETSUPPGIFTER
We are now looking for driven and solution-oriented employees for our bioinformatics team. Your responsibilities can partly be adapted and designed based on your qualificationsbut but there is extra interest for a person with a microbiological background.

The main tasks are as follows:
• Development of new bioinformatics workflows within, among other things, whole genome and transcriptome analysis on everything from viruses to humans.
• Responsibility for operation and continuous improvements of established bioinformatics workflows.
• Development, operation, and improvement of software for visualization and evaluation of bioinformatics results.
• Support for geneticists/molecular biologists regarding the interpretation of genetic data and in technical issues concerning sequencing or bioinformatics.
• Work in national cutting-edge collaborations in genomics and bioinformatics.

Our work is at the technological forefront, and therefore in principle all development of new analyses takes place on site, from the ground up. New analyses are set up on an ongoing basis and as a bioinformatics expert you participate in all aspects from planning, to implementation and validation, and maintenance of robust pipelines. Within the group and in national networks, there is a diversity of expertise in bioinformatics, programming, and systems administration. We share much of our work publicly via github (https://github.com/Clinical-Genomics-Lund) and we use open source software wherever possible.

KVALIFIKATIONER
You have a bachelor's or master's degree in an adequate subject area, i.e. with bioinformatics and genomics as a foundation, or alternatively at least four years' relevant work experience in bioinformatics from industry, healthcare, or academia. You have good knowledge of Swedish and/or English, both verbally and in writing. To be successful in this role you also need experience of:

• Analysis of sequencing data (DNA and / or RNA based).
• The version control system git.
• A terminal-based Linux environment.
• At least one scripting language, such as Python, Perl, or R.

In addition to this, it is an advantage if you have a doctoral education in an adequate research area, i.e. in bioinformatics, genomics or equivalent. It is also beneficial if you have experience of:

• Working with containers (eg Singularity and Docker) and workflow managers (e.g. Nextflow or nfcore or Snakemake).
• Working in a quality management system controlled environment with documentation requirements, such as in an accredited laboratory.
• Working in a common code base.
• Databases ( or mongodb).

The role requires good communication- and collaboration skills, as well as an ability to prioritize your work. You solve problems in your daily work, are thorough and are able to work independently even when existing routines are missing. Great emphasis will be placed on personal suitability.

Please note that this advertisement is also published in Swedish and that this advertisement is linked to a main advertisement.

We apply continuous selection in this recruitment, we look forward to your application.

ÖVRIGT
Region Skåne finns till för att alla som bor i Skåne ska må bra och känna framtidstro. Genom gränslösa samarbeten och omtanke skapas de bästa förutsättningar för ett hälsosamt liv inom näringsliv, kollektivtrafik, kultur och hälso- och sjukvård i Skåne. Tillsammans gör vi livet mera möjligt.

Medicinsk service är en av Region Skånes sex hälso- och sjukvårdsförvaltningar, med cirka 2 000 medarbetare. Vi möter vårdens behov av ambulanssjukvård, bild- och laboratorieteknik, klinisk träning, laboratoriemedicin och sjukvårdsrådgivning. Den laboratoriemedicinska verksamheten omfattar områdena arbets- och miljömedicin, biobank, genetik, immunologi och transfusionsmedicin, kemi, farmakologi, mikrobiologi samt patologi. Förvaltningen bedriver även forskning och utveckling inom sina områden.

På http://www.skane.se/rekryteringsstatus kan du se i vilket skede Region Skånes rekryteringar befinner sig och hur många som har sökt tjänsterna.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser. Visa mindre

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns cirka 44 000 studenter och mer än 8 000 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.


Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.



Lunds Tekniska Högskola, LTH, är en teknisk fakultet inom Lunds universitet med forskning av hög internationell klass och stora satsningar på pedagogisk mångfald.

National Bioinformatics Infrastructure Sweden (https://nbis.se/)  är en nationell infrastruktur som främjar forskning inom livsvetenskaperna i Sverige genom att tillhandahålla support, infrastruktur och avancerad utbildning inom bioinformatikområdet. Vi ger projektsupport inom bland annat följande områden genomik, transkriptomik, proteomik, metabolomik och statistik, omikintegration, data management, systemutveckling, datavetenskaplig expertis och mer.

Vi söker nu två nya medarbetare för att stödja svenska forskare i avancerade bioinformatiska projekt. En tjänst kommer att inrättas vid Institutionen för Laboratoriemedicin vid Medicinska fakulteten och en inrättas vid Institutionen för Immunteknologi vid Lunds Tekniska Högskola.

De personer som anställs kommer att integreras i ett bioinformatikteam med många möjligheter till utveckling av nya och existerande färdigheter för att hålla sig à jour med nya sekvenserings-teknologier och andra bioinformatiska utmaningar när de uppstår. 

Arbetsuppgifter
Vi letar efter experter som primärt kommer att arbeta med analys av data från nästa generations sekvenseringstekniker (NGS) eller tredje generationens sekvensering (långa sekvenser), men också med andra typer av bioinformatiska analyser. Arbetet innefattar att stödja svenska forskare inom detta område. Projekten man deltar i kommer att variera i komplexitet och kan involvera data från olika organismer, inklusive människa, mus och andra modellorganismer, men också från mindre utforskade organismer. Projekten man kommer att jobba med kommer innefatta, men inte begränsas till, RNAseq, single-cell-transkriptomik, genomik, och andra omiktekniker och integration av dessa. 

Ansvarsområden inkluderar att planera, initiera, utföra och rapportera analyser samt kommunicera med forskargrupper samt hålla sig uppdaterad inom fältet och att ibland engageras i avancerad utbildning av svenska forskare inom bioinformatik. Regelbundna interna möten och internutbildning, samt tid för utveckling av egna färdigheter och lärande från en diversifierad grupp av NBIS-kollegor ger förutsättningar för NBIS-bioinformatikerna att utföra högklassiga bioinformatikanalyser.

Kvalifikationer
Den framgångsrika sökande behöver uppfylla följande krav:

- PhD inom något av följande områden: bioinformatik, molekylärbiologi, datavetenskap eller ett närgränsande fält. 
- Erfarenhet av arbete (minst 3 år) med nästa generations sekvenseringsdata eller annan omikdata från högkapacitetsmetoder är ett måste.
- Erfarenhet av expressionsanalyser och förmågan att genomföra och kritiskt evaluera sådana analyser till en internationellt sett hög standard.
- God förmåga i ett skriptspråk såsom R eller Python
- Arbeta effektivt i Linux kommandoradsmiljö
- Mycket god förmåga att kommunicera på engelska, både i tal och skrift

Du behöver ha förmåga att driva projekt självständigt. NBIS verksamhet är serviceinriktad med mycket samarbete och kommunikation, det är därför viktigt att du har en god kommunikativ förmåga och ha lätt för att samarbeta med andra.

Meriternade för tjänsten är:

- Erfarenhet av integrativa analyser av omikdata, cancerspecifika analyser, spatialomikanalyser, analyser av single cell-experiment eller helgenomsekvensering.
- Erfarenhet av tillämpning av multivariat och univariat statistik på omikdata.
- Erfarenhet av support inom bioinformatik
- Postdoktoral erfarenhet
- Dokumenterad kunskap i programmering, maskininlärning och biostatistik

Vi kommer att sätta större vikt vid personliga egenskaper än formella akademiska meriter. Hänsyn kommer också ges till god samarbetsförmåga, driv och oberoende, samt hur bra sökandes erfarenhet och färdigheter kompletterar och stärker NBIS:s nuvarande verksamhet och framtida utveckling.

Instruktioner för ansökan
Ansökan bör innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan bör även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.).

Övrigt
Anställningarna är tillsvidare på 100%, med startdatum 2021-11-01 eller enligt överenskommelse, provanställning kan komma att tillämpas. 
Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.

Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Vi ser jämställdhet och mångfald som en styrka och tillgång. Välkommen med din ansökan! Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler. Visa mindre

Description of the company:
TIGERQ has developed the first successful unified variant frequency analysis between SNPs, small indels, and structural variants in a single algorithm. This discovery paves the way for batter variant discovery and superior frequency assessment in the clinical setting. As a result, TIGERQ is developing a world leading approach for clinical mutational analysis that already today surpassed the top established workflows worldwide, with drastic differences in discovery and accuracy. As part of the deployment of this development TIGERQ provides NGS analysis solutions, as well as integrated full-service sequencing pipelines. As a company we strive to meet our clients’ needs, with an unprecedented value offer. It is our goal - to accelerate biomedical innovation, with the mission of providing immediate-access, fast turnaround, and high-quality NGS analysis solutions - with the outmost emphasis on analytical accuracy!

Description of position:
The Bioinformatic Software Engineer position is meant to accelerate the development and deployment of TIGERQ clinically oriented analysis, with a second focus on NGS analysis pipeline management. The Bioinformatic Software Engineer will work to push forward, validate, and optimize the generalized TIGERQ whole genome sequencing analysis as well as managing a number of distinct NGS pipelines for running analysis services (WGS, RNAseq, ChIPseq). As part of our startup acceleration team the Bioinformatic Software Engineer will work closely with marketing, sales and production scientists to give key insight into the complexities and opportunities of current state-of-the-art NGS workflows.

Duties and Responsibilities:
Use TIGERQ principles to develop, validate, and optimize our proprietary WGS analysis in preparation for translational testing and implementation.
Develop and adopt computational pipelines for key NGS applications as part of TIGERQ services on cloud based HPC framework.
Communicate with users, consultants, and web development team to push quality development of analysis pipelines.
Analyze sequenced TIGERQ samples with current and future pipelines using HPC framework.
Prepare and give presentations on current analysis products and R&D progress.
Collaborate with sales and marketing team to develop marketing materials and sales strategies.
Take part in a flexible and dynamic startup working environment.


Qualifications:
PhD or MS in Bioinformatics, Computer Science, Computational Biology or a related field.
Important – more than 6 years of post-graduate computational work experience.
Important - Robust experience in Python programming and demonstrated experience in other programming/scripting languages: R, Bash, Matlab. There will be a critical programming focus for this position.
Important - deep understanding of NGS variant calling methods, with accompanying statistical calculations.
Important - Experience designing and developing research and/or production grade bioinformatics tools and pipelines for NGS applications.
Hands-on experience with genome alignment, mapping, variant calling, and annotation (e.g. BWA, Bowtie, STAR, GATK, samtools, SV callers).
Hands-on experience with bioinformatics methods appropriate for NGS applications (targeted sequencing, RNAseq, ChIPseq, and de novo genome assembly).
Experience with Azure Cloud infrastructure preferred
Experience working in an entrepreneurial environment preferred.
Fluent in English, with Swedish as a plus. Nearly all communication will be in English.


Skills:
High emphasis on self-motivation, integrity, independence, work schedule management, work planning, and problem solving.
Excellent communication and interpersonal skills and ability to effectively collaborate with other team members and cross discipline functionalities.
Excellent written and oral communication skills.
Excellent organizational skills, prioritization, and attention to details.
Ability to learn as part of a rapidly developing product/service portfolio.
Understanding the startup culture, through active engagement, lean performance, and iterative milestones.
Professionalism and ability to work as a team, to collaborate across duties and responsibilities to provide a healthy working environment and optimal performance.



Our offer
We offer a competitive full time 1-year contract position, with an option for permanent position based on job performance. Globally, within the company this is a leadership position with key opportunities for development. As such, this position is a springboard for professional acceleration and broad-base experiences in a high growth, dynamic, startup environment. Specifically, candidates are in position to drive the leadership and structure of upcoming bioinformatic team expansion.

How to apply
Please send your CV and cover letter by email to [email protected]

*Contact from recruitment companies is not desired. Visa mindre

Arbetsbeskrivning
Här är möjligheten för dig som Bioinformatiker, att ansluta till ett bolag som verkar längst fram i skärningspunkten mjukvara och genetik.  Med nya tekniker inom Next Generation Sequencing (NGS), får ditt och bolagets arbete en direkt effekt i att hjälpa människor världen över. Här eftersöks du som identifierar dig som en bred, ingenjörsmässig bioinformatiker med stort intresse för att arbeta med de senaste lösningarna, ge support, skapa en god struktur och förbättra. 

Ansvarsområden
Hos Qlucore får du möjlighet att vara bolagets första Bioinformatiker och därmed ta helhetsgreppet för detta område och agera expert både internt och externt. Du får komma in, skapa dig en uppfattning om befintliga metoder och verktyg och sedan vara drivande i att interagera med dem och omsätta kunskap så att de kan förbättras och utvecklas. Dina främsta kontaktytor internt blir utvecklings- samt säljteamet. Externt blir det så småningom användarna, där du får möjlighet att agera utbildare i produkterna ute i klinisk miljö. 

Qlucore är ett bolag i tillväxt, med ett befintligt team av mycket kompetenta människor. Så i den här rollen finns stor möjlighet att lära, men också att bidra med kunskap till ett team där man vill lyssna. Eftersom detta är en ny roll, i ett ännu litet bolag, så kommer du att få stora möjligheter att påverka. Du får ett uppdrag och förutsättningar och får möjlighet att driva och lägga upp arbetet som du anser bäst för att nå målet. Kärnan blir att arbeta med data pipelines i relation till den nya produkten Qlucore Diagnostics. 

Kvalifikationer
För att trivas och prestera i rollen, ser vi att du har följande erfarenhet och kompetens med dig: 

• Examen inom bioinformatik, matematik och/eller statistik
• Minimum tre års arbetslivserfarenhet så som bioinformatiker och då i en roll med eget ansvar
• God erfarenhet och kunskap i att sammanställa och skriva teknisk dokumentation
• Vetenskapligt intresse 
• En god förståelse för de sammanhang och miljöer som bioinformatiska lösningar existerar i, exempelvis arbetsflöden
• Mycket goda kunskaper i engelska, i såväl tal som skrift

Vi ser det som meriterande om du har disputerat, samt om du har klinisk erfarenhet. Extra glada blir vi om du har erfarenhet av arbete med bioinformatik och programvara för klinisk diagnostik inom genetik. 

Som person ser vi att du trivs med att lära nytt, är nyfiken, effektiv, ansvarstagande och självständig. Du har en kommunikativ och pedagogisk ådra, som gör att du tycker om att skriva och att utbilda andra. Vi ser att du har ett högt driv, med god förmåga att prioritera och en naturlig fallenhet för service och för att förstå affären. Du trivs med förändring och med att anta utmaningar inom ditt område. Du anser att det är viktigt att vara noggrann, ha ordning och reda och ha koll på detaljerna. I ditt arbete trivs du med många kontaktytor och i samarbete. Vi tror också att du har lätt för att sätta dig in i produkter och att på ett gynnsamt sätt se att de alltid existerar i ett sammanhang hos kund och vad det innebär.

För oss är det viktigt att all kompetens på arbetsmarknaden tillvaratas. Vi välkomnar alla sökande och eftersträvar mångfald.

Ansökan
Sista ansökningsdag 2021-04-11. Urval och intervjuer kommer att ske löpande. Tjänsten kan komma att bli tillsatt innan sista ansökningsdag, ansök därför så snart som möjligt.

I den här rekryteringen samarbetar Qlucore med Randstad Life Sciences & Engineering. Vid eventuella frågor är du välkommen att kontakta rekryteringskonsult Karolina Andersson [email protected].

Om företaget
Qlucore, som grundades 2007, utvecklar och marknadsför två produkter. Kunderna finns i 35 länder och inkluderar majoriteten av ledande universitetet och stora läkemedelsföretag. Qlucore Omics Explorer, en nästa generations bioinformatikprogramvara för forskning inom biovetenskap, växt- och bioteknikindustri samt den akademiska världen. Qlucore Omics Explorer är ett visualiseringsbaserat program som kombinerar avancerad matematik och statistik med enkelhet och snabbhet bland annat genom en egen och unik underliggande plattform optimerad för snabba beräkningar. Qlucore Diagnostics är den nya produktfamiljen fokuserad på maskininlärningsbaserad cancerdiagnostik. På Qlucore arbetas med teknik i skärningspunkterna mellan avancerad mjukvaruutveckling, modern genetik, avancerad statistik och maskininlärning. Visa mindre

Description of the company:
TIGERQ has developed the first successful integrated variant frequency analysis between small indels and structural variants. As a result, TIGERQ is developing a world leading approach for clinical mutational analysis that already today surpassed the top established workflows worldwide, with drastic difference. If you are a bioinformatician you know what this means for patients worldwide. As part of this deployment TIGERQ provides Gene Editing analysis solutions, as well as integrated full-service sequencing pipelines. As a company we strive to meet our clients’ needs, with an unprecedented value offer. It is our goal - to accelerate biomedical innovation, and our mission to provide immediate-access, fast turnaround, and cost-effective Gene Editing analysis solutions - with the outmost emphasis on analytical accuracy!


Description of position:
The Bioinformatic Software Engineer position is meant to accelerate the pace and capacity for TIGERQ market entry, with a specific focus on accurate NGS analysis and product development. The Bioinformatic Software Engineer will work to develop a number of NGS pipelines for different experimental questions (WGS, RNAseq, ChIPseq), and develop current patented TIGERQ analysis towards WGS mutational quantification. As part of our startup acceleration team the Bioinformatic Software Engineer will work closely with marketing, sales and production scientists to give key insight into the complexities and opportunities of current state-of-the-art NGS workflows.


Duties and Responsibilities:
Use current TIGERQ principles to build a new high accuracy WGS mutational analysis tool for pre-clinical testing.
Develop pipelines for key NGS applications to be offered as part of TIGERQ services.
Communicate with users, consultants, and web development team to push quality development of analysis pipelines.
Analyze sequenced TIGERQ samples with current and future pipelines using HPC framework.
Prepare and give presentations on current analysis products and R&D progress.
Collaborate with sales and marketing team to develop marketing materials and sales strategies.
Take part in a flexible and dynamic startup working environment.



Qualifications:
PhD or MS in Bioinformatics, Computer Science, Computational Biology or a related field.
Important – more than 5 years of post-graduate computational work experience.
Hands-on experience with bioinformatics methods appropriate for NGS applications (targeted sequencing, RNAseq, ChIPseq, and de novo genome assembly).
Hands-on experience with genome alignment, mapping, variant calling, and annotation (e.g. BWA, Bowtie, STAR, GATK, samtools, bcftools).
Important - deep understanding of NGS variant calling methods, with accompanying statistical calculations.
Experience with open source bioinformatics and genome analysis tools (e.g. GATK, samtools, bedtools).
Important - Experience designing and developing research and/or production grade bioinformatics tools and pipelines for NGS applications.
Important - Solid experience in Python, and demonstrated experience in other programming/scripting languages: R, Bash.
Excellent communication and interpersonal skills and ability to effectively collaborate with other team members and cross discipline functionalities.
Experience working in an entrepreneurial environment preferred.
Experience with Azure preferred
Fluent in English, with Swedish as a plus. Nearly all communication will be in English.
Excellent written and oral communication skills.
Excellent organizational skills, prioritization, and attention to details.



Skills:
High emphasis on self-motivation, work schedule management, planning, and problem solving.
Ability to learn as part of a rapidly developing product/service portfolio.
Understanding the startup culture, though active engagement, lean performance, and iterative milestones.
Professionalism and ability to work as a team, to collaborate across duties and responsibilities to provide a healthy working environment and optimal performance.



Our offer
We offer a competitive full time 1-year contract position, with an option for permanent position based on job performance. Globally, within the company this is an entry stage position with key opportunities for development. As such, this position is a springboard for professional acceleration and broad-base experiences in a high growth, dynamic, startup environment. Specifically, candidates are in position to drive the leadership and structure of upcoming bioinformatic team expansion.


How to apply
Please send your CV and cover letter by email to [email protected]


*Contact from recruitment companies is not desired. Visa mindre

The role as BioinformaticianGeneral description and main responsibility As a Bioinformatician at Immunovia you will play an important role in performing statistical data analysis including machine learning strategies and test result interpretation. You will be involved in both research and product development activities, spanning from small tests to large clinical studies. The main tasks are related to interpreting and evaluating study and test results, and to give input to experimental design. Tasks and responsibilities include, but are not limited to: • Develop and perform bioinformatics at Immunovia • Use tools, algorithms and programming language to understand and process biological data generated from the IMMray™ platform • Write plans and reports of various character and level • Perform data analysis of research/development tests of various sizes as well as clinical studies • Interpret the results, draw conclusions and report the findings according to ISO 13 485 requirements • Communicate results and findings for the scientific community in oral and written form • Write scientific documentation such as research articles and publications for scientific meetings • Interact with external contacts and participate in external collaborations • Be up to date with the scientific literature within specific research areas • Continuously improve existing data handling processes • Contribute to new ideas, projects, procedures and technologies • Participate in cross-functional scientific discussions internally and externally • Participate in risk assessments • Adhere to policies and safety procedures Requested qualifications • PhD exam in molecular biology, chemistry, biotechnology or equivalent with experience of bioinformatics, or PhD exam in mathematics, biostatistics, bioinformatics, statistical genomics or proteomics with experience of handling biological data • Several years of experience with processing and interpreting omics data by using tools, algorithms and programming language • Several years of experience with statistical data analysis and machine learning strategies • Several years of experience with experimental design, data interpretation and presentation, and result reporting in scientific journals preferable within proteomics or genomics • Experience from working with R and/or Python • Experience from work in the industry is an advantage but not a requirement • Excellent in English language, both written and oral Personal characteristics • Ability to work in a team and share responsibilities and tasks • Ability to apply specialist and detailed technical expertise • Problem-solving skills with the ability to find creative solutions • Proven ability to work to tight deadlines • Determined to accomplish goals and objectives • Analytical and driving personalitySend your application to: [email protected] Visa mindre